Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ASTN1O14525 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ASTN1O14525 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ASTN1O14525 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ASTN1O14525 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ASTN1O14525 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ASTN1O14525 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
ASTN1O14525 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
ASTN1O14525 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ASTN1O14525 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ASTN1O14525 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ASTN1O14525 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ASTN1O14525 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ASTN1O14525 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ASTN1O14525 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ASTN1O14525 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ASTN1O14525 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ASTN1O14525 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ASTN1O14525 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ASTN1O14525 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ASTN1O14525 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ASTN1O14525 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ASTN1O14525 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ASTN1O14525 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ASTN1O14525 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ASTN1O14525 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ASTN1O14525 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ASTN1O14525 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ASTN1O14525 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ASTN1O14525 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ASTN1O14525 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ASTN1O14525 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ASTN1O14525 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ASTN1O14525 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ASTN1O14525 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ASTN1O14525 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ASTN1O14525 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ASTN1O14525 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
ASTN1O14525 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ASTN1O14525 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ASTN1O14525 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ASTN1O14525 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ASTN1O14525 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ASTN1O14525 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ASTN1O14525 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ASTN1O14525 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ASTN1O14525 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ASTN1O14525 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ASTN1O14525 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ASTN1O14525 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ASTN1O14525 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ASTN1O14525 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ASTN1O14525 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ASTN1O14525 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ASTN1O14525 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ASTN1O14525 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ASTN1O14525 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ASTN1O14525 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ASTN1O14525 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ASTN1O14525 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ASTN1O14525 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ASTN1O14525 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ASTN1O14525 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ASTN1O14525 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ASTN1O14525 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ASTN1O14525 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ASTN1O14525 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ASTN1O14525 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ASTN1O14525 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ASTN1O14525 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ASTN1O14525 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ASTN1O14525 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ASTN1O14525 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ASTN1O14525 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ASTN1O14525 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ASTN1O14525 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ASTN1O14525 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ASTN1O14525 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ASTN1O14525 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ASTN1O14525 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ASTN1O14525 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ASTN1O14525 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ASTN1O14525 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ASTN1O14525 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ASTN1O14525 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ASTN1O14525 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ASTN1O14525 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ASTN1O14525 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ASTN1O14525 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ASTN1O14525 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ASTN1O14525 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ASTN1O14525 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ASTN1O14525 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ASTN1O14525 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ASTN1O14525 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ASTN1O14525 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ASTN1O14525 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ASTN1O14525 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ASTN1O14525 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ASTN1O14525 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms