Protein–RNA interactions for Protein: O14513

NCKAP5, Nck-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP5O14513 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCKAP5O14513 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCKAP5O14513 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCKAP5O14513 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCKAP5O14513 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NCKAP5O14513 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCKAP5O14513 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCKAP5O14513 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCKAP5O14513 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCKAP5O14513 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCKAP5O14513 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCKAP5O14513 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCKAP5O14513 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCKAP5O14513 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCKAP5O14513 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCKAP5O14513 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCKAP5O14513 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCKAP5O14513 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKAP5O14513 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCKAP5O14513 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCKAP5O14513 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCKAP5O14513 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCKAP5O14513 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCKAP5O14513 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCKAP5O14513 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCKAP5O14513 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCKAP5O14513 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCKAP5O14513 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCKAP5O14513 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCKAP5O14513 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCKAP5O14513 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCKAP5O14513 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP5O14513 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCKAP5O14513 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCKAP5O14513 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCKAP5O14513 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCKAP5O14513 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCKAP5O14513 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCKAP5O14513 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCKAP5O14513 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCKAP5O14513 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCKAP5O14513 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCKAP5O14513 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCKAP5O14513 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCKAP5O14513 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCKAP5O14513 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP5O14513 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCKAP5O14513 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP5O14513 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKAP5O14513 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKAP5O14513 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKAP5O14513 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCKAP5O14513 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCKAP5O14513 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCKAP5O14513 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCKAP5O14513 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCKAP5O14513 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCKAP5O14513 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCKAP5O14513 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCKAP5O14513 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCKAP5O14513 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCKAP5O14513 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCKAP5O14513 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCKAP5O14513 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCKAP5O14513 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCKAP5O14513 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCKAP5O14513 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCKAP5O14513 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP5O14513 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKAP5O14513 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCKAP5O14513 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKAP5O14513 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCKAP5O14513 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCKAP5O14513 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKAP5O14513 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCKAP5O14513 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCKAP5O14513 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP5O14513 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKAP5O14513 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCKAP5O14513 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP5O14513 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP5O14513 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP5O14513 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP5O14513 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP5O14513 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP5O14513 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP5O14513 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKAP5O14513 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCKAP5O14513 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCKAP5O14513 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCKAP5O14513 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCKAP5O14513 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCKAP5O14513 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms