Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID1AO14497 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID1AO14497 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID1AO14497 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID1AO14497 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID1AO14497 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID1AO14497 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID1AO14497 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID1AO14497 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID1AO14497 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID1AO14497 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID1AO14497 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID1AO14497 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID1AO14497 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID1AO14497 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID1AO14497 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID1AO14497 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID1AO14497 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID1AO14497 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID1AO14497 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID1AO14497 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID1AO14497 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID1AO14497 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID1AO14497 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID1AO14497 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID1AO14497 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID1AO14497 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID1AO14497 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID1AO14497 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID1AO14497 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID1AO14497 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID1AO14497 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID1AO14497 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID1AO14497 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID1AO14497 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID1AO14497 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID1AO14497 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID1AO14497 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID1AO14497 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID1AO14497 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID1AO14497 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID1AO14497 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID1AO14497 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID1AO14497 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID1AO14497 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID1AO14497 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID1AO14497 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID1AO14497 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID1AO14497 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID1AO14497 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID1AO14497 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID1AO14497 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID1AO14497 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID1AO14497 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID1AO14497 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID1AO14497 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID1AO14497 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID1AO14497 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID1AO14497 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID1AO14497 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID1AO14497 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID1AO14497 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID1AO14497 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID1AO14497 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID1AO14497 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID1AO14497 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID1AO14497 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID1AO14497 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID1AO14497 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID1AO14497 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID1AO14497 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID1AO14497 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID1AO14497 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID1AO14497 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1AO14497 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID1AO14497 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID1AO14497 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARID1AO14497 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID1AO14497 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID1AO14497 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms