Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KLRF2D3W0D1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KLRF2D3W0D1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KLRF2D3W0D1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KLRF2D3W0D1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KLRF2D3W0D1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KLRF2D3W0D1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
KLRF2D3W0D1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KLRF2D3W0D1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KLRF2D3W0D1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KLRF2D3W0D1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KLRF2D3W0D1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KLRF2D3W0D1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KLRF2D3W0D1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KLRF2D3W0D1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KLRF2D3W0D1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KLRF2D3W0D1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KLRF2D3W0D1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KLRF2D3W0D1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KLRF2D3W0D1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KLRF2D3W0D1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KLRF2D3W0D1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KLRF2D3W0D1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KLRF2D3W0D1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KLRF2D3W0D1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KLRF2D3W0D1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KLRF2D3W0D1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KLRF2D3W0D1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KLRF2D3W0D1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KLRF2D3W0D1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KLRF2D3W0D1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KLRF2D3W0D1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KLRF2D3W0D1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KLRF2D3W0D1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KLRF2D3W0D1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KLRF2D3W0D1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KLRF2D3W0D1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KLRF2D3W0D1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KLRF2D3W0D1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KLRF2D3W0D1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KLRF2D3W0D1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KLRF2D3W0D1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KLRF2D3W0D1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KLRF2D3W0D1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KLRF2D3W0D1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KLRF2D3W0D1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KLRF2D3W0D1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
KLRF2D3W0D1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KLRF2D3W0D1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KLRF2D3W0D1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KLRF2D3W0D1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
KLRF2D3W0D1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KLRF2D3W0D1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KLRF2D3W0D1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KLRF2D3W0D1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KLRF2D3W0D1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KLRF2D3W0D1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KLRF2D3W0D1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
KLRF2D3W0D1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KLRF2D3W0D1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KLRF2D3W0D1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
KLRF2D3W0D1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KLRF2D3W0D1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KLRF2D3W0D1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KLRF2D3W0D1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KLRF2D3W0D1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KLRF2D3W0D1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KLRF2D3W0D1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KLRF2D3W0D1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KLRF2D3W0D1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KLRF2D3W0D1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KLRF2D3W0D1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLRF2D3W0D1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KLRF2D3W0D1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KLRF2D3W0D1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLRF2D3W0D1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KLRF2D3W0D1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KLRF2D3W0D1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KLRF2D3W0D1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLRF2D3W0D1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KLRF2D3W0D1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KLRF2D3W0D1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KLRF2D3W0D1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KLRF2D3W0D1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KLRF2D3W0D1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KLRF2D3W0D1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KLRF2D3W0D1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
KLRF2D3W0D1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KLRF2D3W0D1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KLRF2D3W0D1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KLRF2D3W0D1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KLRF2D3W0D1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KLRF2D3W0D1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KLRF2D3W0D1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms