Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
A6NNC1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
A6NNC1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A6NNC1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A6NNC1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A6NNC1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
A6NNC1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A6NNC1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
A6NNC1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
A6NNC1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A6NNC1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A6NNC1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A6NNC1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A6NNC1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NNC1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NNC1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NNC1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A6NNC1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A6NNC1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NNC1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A6NNC1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NNC1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NNC1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NNC1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A6NNC1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NNC1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NNC1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NNC1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NNC1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A6NNC1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A6NNC1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A6NNC1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A6NNC1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
A6NNC1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
A6NNC1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A6NNC1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NNC1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A6NNC1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A6NNC1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A6NNC1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A6NNC1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A6NNC1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A6NNC1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A6NNC1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A6NNC1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A6NNC1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A6NNC1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
A6NNC1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A6NNC1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A6NNC1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A6NNC1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A6NNC1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A6NNC1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A6NNC1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A6NNC1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A6NNC1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A6NNC1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A6NNC1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A6NNC1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A6NNC1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A6NNC1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A6NNC1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A6NNC1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A6NNC1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A6NNC1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A6NNC1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A6NNC1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A6NNC1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A6NNC1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A6NNC1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A6NNC1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A6NNC1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A6NNC1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A6NNC1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A6NNC1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A6NNC1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNC1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNC1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNC1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A6NNC1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A6NNC1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A6NNC1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A6NNC1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNC1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A6NNC1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A6NNC1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A6NNC1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A6NNC1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A6NNC1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNC1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNC1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNC1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNC1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A6NNC1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNC1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
A6NNC1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NNC1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NNC1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A6NNC1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A6NNC1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms