Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRBV4-1A0A0J9YWV2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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