Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYJ7

TRAV8-3, T-cell receptor alpha variable 8-3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms