Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms