Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FAM3DQ96BQ1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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