Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms