Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBDO15205 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBDO15205 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBDO15205 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBDO15205 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBDO15205 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms