Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms