Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 11.9
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SND1Q7KZF4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 11.9
SND1Q7KZF4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 11.9
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SND1Q7KZF4 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-9■■□□□ 11.9
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SND1Q7KZF4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 11.8
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SND1Q7KZF4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.756e-8■■□□□ 11.8
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SND1Q7KZF4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-7■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.75e-7■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 SUN2-215ENST00000470642 571 ntTSL 39.41□□□□□ -0.94e-7■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.861e-7■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-10■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.662e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.368e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.322e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.76■□□□□ 0.272e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-13■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 ST6GAL1-204ENST00000423451 602 ntTSL 410.22□□□□□ -0.777e-19■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 SKP1-204ENST00000517691 2033 ntTSL 1 (best)3.75□□□□□ -1.813e-12■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 SPTAN1-204ENST00000461855 857 ntTSL 210.49□□□□□ -0.733e-6■■□□□ 11.8
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SND1Q7KZF4 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.942e-12■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 SKP1-207ENST00000520417 610 ntTSL 37.95□□□□□ -1.142e-12■■□□□ 11.8
SND1Q7KZF4 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-12■■□□□ 11.8
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