Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms