Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms