Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOA1P02647 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOA1P02647 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms