Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX6O95475 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX6O95475 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX6O95475 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX6O95475 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX6O95475 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX6O95475 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX6O95475 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX6O95475 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms