Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TCP1-204ENST00000467544 658 ntTSL 21.48□□□□□ -2.174e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 XRN1-214ENST00000498077 5600 ntTSL 51.38□□□□□ -2.194e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 UCHL5-212ENST00000449480 784 ntTSL 31.05□□□□□ -2.244e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 CS-223ENST00000551137 903 ntTSL 39.91□□□□□ -0.828e-11■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 CBX3-205ENST00000462165 949 ntTSL 39.63□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 INTS1-205ENST00000483196 386 ntTSL 58.96□□□□□ -0.973e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 TM7SF3-213ENST00000543655 568 ntTSL 38.73□□□□□ -1.013e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPRC1-205ENST00000489648 744 ntTSL 58.5□□□□□ -1.053e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 CS-218ENST00000550159 646 ntTSL 58.1□□□□□ -1.118e-11■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 CS-224ENST00000551155 558 ntTSL 37.78□□□□□ -1.161e-12■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 CS-220ENST00000550700 559 ntTSL 47.68□□□□□ -1.181e-12■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TM7SF3-203ENST00000535260 883 ntTSL 37.44□□□□□ -1.229e-15■■■■■ 34.1
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