RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.09■■■■□ 3.21
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TM7SF3-211ENST00000542667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-211ENST00000542667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.48■■■□□ 2.31
TM7SF3-211ENST00000542667 NACADO15069 1562 aa29.38■■■□□ 2.29
TM7SF3-211ENST00000542667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TM7SF3-211ENST00000542667 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.05■■■□□ 2.24
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TM7SF3-211ENST00000542667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-211ENST00000542667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
TM7SF3-211ENST00000542667 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.68■■■□□ 2.18
TM7SF3-211ENST00000542667 SCRIBQ14160 1630 aa28.63■■■□□ 2.17
TM7SF3-211ENST00000542667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.58■■■□□ 2.17
TM7SF3-211ENST00000542667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
TM7SF3-211ENST00000542667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-211ENST00000542667 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.7■■■□□ 2.03
TM7SF3-211ENST00000542667 SMARCA4P51532 1647 aa27.28■■□□□ 1.96
TM7SF3-211ENST00000542667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.17■■□□□ 1.94
TM7SF3-211ENST00000542667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TM7SF3-211ENST00000542667 NCAPD3P42695 1498 aa27.13■■□□□ 1.93
TM7SF3-211ENST00000542667 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.12■■□□□ 1.93
TM7SF3-211ENST00000542667 SMARCA2P51531 1590 aa27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3-211ENST00000542667 HMGXB3Q12766 1538 aa26.95■■□□□ 1.91
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TM7SF3-211ENST00000542667 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.93■■□□□ 1.9
TM7SF3-211ENST00000542667 WIZO95785 1651 aa26.85■■□□□ 1.89
TM7SF3-211ENST00000542667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-211ENST00000542667 NESP48681 1621 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-211ENST00000542667 ERCC6Q03468 1493 aa26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-211ENST00000542667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3-211ENST00000542667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3-211ENST00000542667 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.36■■□□□ 1.81
TM7SF3-211ENST00000542667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.34■■□□□ 1.81
TM7SF3-211ENST00000542667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3-211ENST00000542667 CUX2O14529 1486 aa26.24■■□□□ 1.79
TM7SF3-211ENST00000542667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.2■■□□□ 1.78
TM7SF3-211ENST00000542667 CFTRP13569 1480 aa26.16■■□□□ 1.78
TM7SF3-211ENST00000542667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.05■■□□□ 1.76
TM7SF3-211ENST00000542667 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.04■■□□□ 1.76
TM7SF3-211ENST00000542667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TM7SF3-211ENST00000542667 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3-211ENST00000542667 WDR62O43379 1518 aa25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3-211ENST00000542667 PRDM2Q13029 1718 aa25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3-211ENST00000542667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TM7SF3-211ENST00000542667 TOPBP1Q92547 1522 aa25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3-211ENST00000542667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.58■■□□□ 1.69
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCC8Q09428 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 IFT140Q96RY7 1462 aa25.48■■□□□ 1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 CUX1P39880 1505 aa25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3-211ENST00000542667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3-211ENST00000542667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.4■■□□□ 1.66
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TM7SF3-211ENST00000542667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.36■■□□□ 1.65
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TM7SF3-211ENST00000542667 SOGA1O94964 1423 aa25.33■■□□□ 1.65
TM7SF3-211ENST00000542667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-211ENST00000542667 OSCARQ8IYS5 282 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-211ENST00000542667 SYNJ1O43426 1573 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-211ENST00000542667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-211ENST00000542667 WDR97A6NE52 1622 aa25.14■■□□□ 1.61
TM7SF3-211ENST00000542667 TOP2BQ02880 1626 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3-211ENST00000542667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3-211ENST00000542667 FBLN2P98095 1184 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3-211ENST00000542667 CHD1O14646 1710 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3-211ENST00000542667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.04■■□□□ 1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 PBRM1Q86U86 1689 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 GRIN2BQ13224 1484 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.99■■□□□ 1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 TRIM41Q8WV44 630 aa24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TM7SF3-211ENST00000542667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TM7SF3-211ENST00000542667 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 SYNJ2O15056 1496 aa24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGEF11O15085 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3-211ENST00000542667 ADAMTS12P58397 1594 aa24.77■■□□□ 1.56
TM7SF3-211ENST00000542667 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3-211ENST00000542667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-211ENST00000542667 GRIN2AQ12879 1464 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-211ENST00000542667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-211ENST00000542667 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.67■■□□□ 1.54
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP170Q5SW79 1584 aa24.64■■□□□ 1.54
TM7SF3-211ENST00000542667 ARAP1Q96P48 1450 aa24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3-211ENST00000542667 KIF27Q86VH2 1401 aa24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3-211ENST00000542667 IGF1RP08069 1367 aa24.59■■□□□ 1.53
TM7SF3-211ENST00000542667 NUP160Q12769 1436 aa24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3-211ENST00000542667 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3-211ENST00000542667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.52■■□□□ 1.52
TM7SF3-211ENST00000542667 CUL7Q14999 1698 aa24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3-211ENST00000542667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.43■■□□□ 1.5
TM7SF3-211ENST00000542667 SHROOM2Q13796 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
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