RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-220ENST00000550700 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CS-220ENST00000550700 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-220ENST00000550700 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.94■□□□□ 0.62
CS-220ENST00000550700 ABCC9O60706 1549 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-220ENST00000550700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CS-220ENST00000550700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.12■□□□□ 0.49
CS-220ENST00000550700 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-220ENST00000550700 NACADO15069 1562 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-220ENST00000550700 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-220ENST00000550700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.93■□□□□ 0.46
CS-220ENST00000550700 POTEDQ86YR6 584 aa17.65■□□□□ 0.42
CS-220ENST00000550700 SCRIBQ14160 1630 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-220ENST00000550700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-220ENST00000550700 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.3■□□□□ 0.36
CS-220ENST00000550700 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.26■□□□□ 0.35
CS-220ENST00000550700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.13■□□□□ 0.33
CS-220ENST00000550700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.3
CS-220ENST00000550700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CS-220ENST00000550700 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-220ENST00000550700 SMARCA4P51532 1647 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-220ENST00000550700 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-220ENST00000550700 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-220ENST00000550700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-220ENST00000550700 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-220ENST00000550700 SMARCA2P51531 1590 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-220ENST00000550700 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-220ENST00000550700 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CS-220ENST00000550700 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-220ENST00000550700 NCAPD3P42695 1498 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-220ENST00000550700 WIZO95785 1651 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-220ENST00000550700 HMGXB3Q12766 1538 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-220ENST00000550700 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-220ENST00000550700 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
CS-220ENST00000550700 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-220ENST00000550700 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-220ENST00000550700 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.24■□□□□ 0.19
CS-220ENST00000550700 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-220ENST00000550700 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-220ENST00000550700 PRDM2Q13029 1718 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-220ENST00000550700 CFTRP13569 1480 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-220ENST00000550700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.99■□□□□ 0.15
CS-220ENST00000550700 NESP48681 1621 aa15.93■□□□□ 0.14
CS-220ENST00000550700 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-220ENST00000550700 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-220ENST00000550700 ABCC8Q09428 1581 aa15.83■□□□□ 0.13
CS-220ENST00000550700 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.83■□□□□ 0.13
CS-220ENST00000550700 ERCC6Q03468 1493 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-220ENST00000550700 FOXD1Q16676 465 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-220ENST00000550700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
CS-220ENST00000550700 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-220ENST00000550700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.74■□□□□ 0.11
CS-220ENST00000550700 TOP2BQ02880 1626 aa15.72■□□□□ 0.11
CS-220ENST00000550700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.72■□□□□ 0.11
CS-220ENST00000550700 TRIM41Q8WV44 630 aa15.69■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 WDR62O43379 1518 aa15.68■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 TOPBP1Q92547 1522 aa15.68■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 CUX1P39880 1505 aa15.68■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 SYNJ1O43426 1573 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-220ENST00000550700 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-220ENST00000550700 CUX2O14529 1486 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-220ENST00000550700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CS-220ENST00000550700 IFT140Q96RY7 1462 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-220ENST00000550700 SOGA1O94964 1423 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-220ENST00000550700 WDR97A6NE52 1622 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-220ENST00000550700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.49■□□□□ 0.07
CS-220ENST00000550700 EEA1Q15075 1411 aa15.49■□□□□ 0.07
CS-220ENST00000550700 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CS-220ENST00000550700 KIF27Q86VH2 1401 aa15.45■□□□□ 0.06
CS-220ENST00000550700 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.44■□□□□ 0.06
CS-220ENST00000550700 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.38■□□□□ 0.05
CS-220ENST00000550700 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.37■□□□□ 0.05
CS-220ENST00000550700 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-220ENST00000550700 MSH5O43196 834 aa15.35■□□□□ 0.05
CS-220ENST00000550700 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CS-220ENST00000550700 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
CS-220ENST00000550700 GRIN2BQ13224 1484 aa15.33■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 PBRM1Q86U86 1689 aa15.32■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.32■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 CUL7Q14999 1698 aa15.31■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.3■□□□□ 0.043e-15■■■■■ 29.1
CS-220ENST00000550700 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 IGF1RP08069 1367 aa15.27■□□□□ 0.04
CS-220ENST00000550700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.27■□□□□ 0.03
CS-220ENST00000550700 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
CS-220ENST00000550700 KIF21BO75037 1637 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-220ENST00000550700 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CS-220ENST00000550700 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-220ENST00000550700 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-220ENST00000550700 PRXQ9BXM0 1461 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-220ENST00000550700 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-220ENST00000550700 ADAMTS12P58397 1594 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-220ENST00000550700 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-220ENST00000550700 SYNJ2O15056 1496 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-220ENST00000550700 GOLGA3Q08378 1498 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-220ENST00000550700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-220ENST00000550700 GRIN2AQ12879 1464 aa15.1■□□□□ 0.01
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