RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.76■■■■■ 4.12
CS-227ENST00000551441 ABCC9O60706 1549 aa37.15■■■■□ 3.54
CS-227ENST00000551441 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.63■■■■□ 3.45
CS-227ENST00000551441 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.17■■■■□ 3.22
CS-227ENST00000551441 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.07■■■■□ 3.2
CS-227ENST00000551441 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.8■■■■□ 3.16
CS-227ENST00000551441 NACADO15069 1562 aa34.7■■■■□ 3.15
CS-227ENST00000551441 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
CS-227ENST00000551441 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.38■■■■□ 3.09
CS-227ENST00000551441 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.11■■■■□ 3.05
CS-227ENST00000551441 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.01■■■■□ 3.04
CS-227ENST00000551441 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
CS-227ENST00000551441 SCRIBQ14160 1630 aa33.56■■■□□ 2.96
CS-227ENST00000551441 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.51■■■□□ 2.95
CS-227ENST00000551441 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.48■■■□□ 2.95
CS-227ENST00000551441 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.43■■■□□ 2.94
CS-227ENST00000551441 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.38■■■□□ 2.93
CS-227ENST00000551441 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
CS-227ENST00000551441 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.39■■■□□ 2.78
CS-227ENST00000551441 NCAPD3P42695 1498 aa32.05■■■□□ 2.72
CS-227ENST00000551441 ERCC6Q03468 1493 aa32.04■■■□□ 2.72
CS-227ENST00000551441 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.98■■■□□ 2.71
CS-227ENST00000551441 CUX2O14529 1486 aa31.97■■■□□ 2.71
CS-227ENST00000551441 SMARCA4P51532 1647 aa31.89■■■□□ 2.7
CS-227ENST00000551441 NESP48681 1621 aa31.84■■■□□ 2.69
CS-227ENST00000551441 SMARCA2P51531 1590 aa31.81■■■□□ 2.68
CS-227ENST00000551441 HMGXB3Q12766 1538 aa31.77■■■□□ 2.68
CS-227ENST00000551441 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CS-227ENST00000551441 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
CS-227ENST00000551441 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.48■■■□□ 2.63
CS-227ENST00000551441 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
CS-227ENST00000551441 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.47■■■□□ 2.63
CS-227ENST00000551441 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.39■■■□□ 2.62
CS-227ENST00000551441 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.38■■■□□ 2.61
CS-227ENST00000551441 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.24■■■□□ 2.59
CS-227ENST00000551441 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CS-227ENST00000551441 WIZO95785 1651 aa31.13■■■□□ 2.57
CS-227ENST00000551441 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.12■■■□□ 2.57
CS-227ENST00000551441 TRIM41Q8WV44 630 aa31.04■■■□□ 2.56
CS-227ENST00000551441 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.02■■■□□ 2.56
CS-227ENST00000551441 WDR62O43379 1518 aa30.93■■■□□ 2.54
CS-227ENST00000551441 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.85■■■□□ 2.53
CS-227ENST00000551441 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.81■■■□□ 2.52
CS-227ENST00000551441 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CS-227ENST00000551441 CFTRP13569 1480 aa30.67■■■□□ 2.5
CS-227ENST00000551441 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
CS-227ENST00000551441 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CS-227ENST00000551441 OSCARQ8IYS5 282 aa30.55■■■□□ 2.48
CS-227ENST00000551441 PRDM2Q13029 1718 aa30.35■■■□□ 2.45
CS-227ENST00000551441 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.32■■■□□ 2.44
CS-227ENST00000551441 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CS-227ENST00000551441 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
CS-227ENST00000551441 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
CS-227ENST00000551441 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
CS-227ENST00000551441 IFT140Q96RY7 1462 aa30.21■■■□□ 2.43
CS-227ENST00000551441 TOPBP1Q92547 1522 aa30.18■■■□□ 2.42
CS-227ENST00000551441 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CS-227ENST00000551441 ARHGEF11O15085 1522 aa30.06■■■□□ 2.4
CS-227ENST00000551441 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.02■■■□□ 2.4
CS-227ENST00000551441 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.43e-15■■■■■ 29.1
CS-227ENST00000551441 ABCC8Q09428 1581 aa29.98■■■□□ 2.39
CS-227ENST00000551441 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.96■■■□□ 2.39
CS-227ENST00000551441 CHD1O14646 1710 aa29.96■■■□□ 2.39
CS-227ENST00000551441 FBLN2P98095 1184 aa29.94■■■□□ 2.38
CS-227ENST00000551441 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CS-227ENST00000551441 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CS-227ENST00000551441 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.85■■■□□ 2.37
CS-227ENST00000551441 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CS-227ENST00000551441 ARAP1Q96P48 1450 aa29.76■■■□□ 2.35
CS-227ENST00000551441 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CS-227ENST00000551441 SOGA1O94964 1423 aa29.73■■■□□ 2.35
CS-227ENST00000551441 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.66■■■□□ 2.34
CS-227ENST00000551441 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.65■■■□□ 2.34
CS-227ENST00000551441 CUX1P39880 1505 aa29.58■■■□□ 2.33
CS-227ENST00000551441 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CS-227ENST00000551441 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.51■■■□□ 2.32
CS-227ENST00000551441 SYNJ1O43426 1573 aa29.47■■■□□ 2.31
CS-227ENST00000551441 GRIN2BQ13224 1484 aa29.46■■■□□ 2.31
CS-227ENST00000551441 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CS-227ENST00000551441 WDR97A6NE52 1622 aa29.45■■■□□ 2.3
CS-227ENST00000551441 SYNJ2O15056 1496 aa29.39■■■□□ 2.3
CS-227ENST00000551441 PBRM1Q86U86 1689 aa29.38■■■□□ 2.29
CS-227ENST00000551441 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.36■■■□□ 2.29
CS-227ENST00000551441 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.35■■■□□ 2.29
CS-227ENST00000551441 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CS-227ENST00000551441 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.23■■■□□ 2.27
CS-227ENST00000551441 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.22■■■□□ 2.27
CS-227ENST00000551441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.18■■■□□ 2.26
CS-227ENST00000551441 GRIN2AQ12879 1464 aa29.1■■■□□ 2.25
CS-227ENST00000551441 CEP170Q5SW79 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
CS-227ENST00000551441 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
CS-227ENST00000551441 ADAMTS12P58397 1594 aa29.05■■■□□ 2.24
CS-227ENST00000551441 NUP160Q12769 1436 aa28.98■■■□□ 2.23
CS-227ENST00000551441 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.97■■■□□ 2.23
CS-227ENST00000551441 TOP2BQ02880 1626 aa28.96■■■□□ 2.23
CS-227ENST00000551441 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.93■■■□□ 2.22
CS-227ENST00000551441 SHROOM2Q13796 1616 aa28.88■■■□□ 2.21
CS-227ENST00000551441 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.83■■■□□ 2.21
CS-227ENST00000551441 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CS-227ENST00000551441 JPH4Q96JJ6 628 aa28.76■■■□□ 2.19
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