Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.349e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.369e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.379e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.379e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.49e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.439e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.439e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ZCCHC11-220ENST00000528642 3854 ntTSL 512.24□□□□□ -0.459e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.469e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PBX2-203ENST00000480254 580 ntTSL 212.12□□□□□ -0.479e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.489e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.519e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 POFUT2-208ENST00000471540 3176 ntTSL 511.85□□□□□ -0.519e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-205ENST00000504591 401 ntTSL 211.81□□□□□ -0.529e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-206ENST00000506855 468 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.529e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.529e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-201ENST00000355938 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.529e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.539e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.539e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 511.62□□□□□ -0.559e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 211.25□□□□□ -0.619e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.639e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 311.12□□□□□ -0.639e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.649e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 KDM2A-213ENST00000531696 4160 ntTSL 510.92□□□□□ -0.669e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 210.91□□□□□ -0.669e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TUT1-205ENST00000476907 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.689e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 410.75□□□□□ -0.699e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 510.71□□□□□ -0.79e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.729e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 210.17□□□□□ -0.789e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.819e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.839e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.839e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.899e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 BRAF-205ENST00000497784 2336 ntTSL 59.45□□□□□ -0.99e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 GAB3-202ENST00000369575 4718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.919e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 KDM2A-204ENST00000524657 3692 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.919e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 29.33□□□□□ -0.929e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ATP5G1-207ENST00000513347 2214 ntTSL 29.32□□□□□ -0.929e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CALCOCO2-205ENST00000502761 724 ntTSL 29.28□□□□□ -0.929e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 29.13□□□□□ -0.959e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ERF-205ENST00000595941 227 ntTSL 48.79□□□□□ -19e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.019e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 AKAP1-216ENST00000575322 650 ntTSL 47.47□□□□□ -1.219e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.269e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 UBAP2L-217ENST00000489076 850 ntTSL 27.13□□□□□ -1.279e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.349e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 GAB3-206ENST00000496390 4240 ntTSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.369e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CCDC6-202ENST00000491922 2642 ntTSL 26.14□□□□□ -1.439e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.549e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.639e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.649e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 RELA-207ENST00000526257 215 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.719e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 314.63□□□□□ -0.078e-8■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ALG3-204ENST00000423996 904 ntTSL 223.26■■□□□ 1.315e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ALG3-209ENST00000462735 704 ntTSL 215.92■□□□□ 0.145e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ALG3-210ENST00000463495 347 ntTSL 310.85□□□□□ -0.675e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 526.22■■□□□ 1.791e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)24.43■■□□□ 1.51e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.461e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.371e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.351e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 HSPG2-211ENST00000486901 3586 ntTSL 211.96□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 VIM-203ENST00000469543 2666 ntTSL 219.58■□□□□ 0.723e-21■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-21■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 VIM-209ENST00000544301 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.75■□□□□ 0.593e-21■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 VIM-206ENST00000487938 2272 ntTSL 518.32■□□□□ 0.523e-21■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 VIM-202ENST00000421459 753 ntTSL 28.96□□□□□ -0.983e-21■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 VIM-207ENST00000495528 962 ntTSL 27.91□□□□□ -1.143e-21■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 CIT-207ENST00000536325 329 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 517.18■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.137e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.947e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-205ENST00000524570 1934 ntTSL 217.7■□□□□ 0.427e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.267e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-220ENST00000532884 819 ntTSL 515.98■□□□□ 0.157e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.037e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.147e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-215ENST00000560763 723 ntTSL 220.78■□□□□ 0.926e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-214ENST00000560338 580 ntTSL 318.96■□□□□ 0.636e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.526e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-210ENST00000559249 704 ntTSL 218.22■□□□□ 0.516e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-203ENST00000558265 872 ntTSL 515.47■□□□□ 0.076e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-216ENST00000560877 521 ntTSL 415.17■□□□□ 0.026e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-204ENST00000558316 719 ntTSL 314.64□□□□□ -0.076e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 EIF5-213ENST00000560200 776 ntTSL 57.54□□□□□ -1.26e-20■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.863e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.043e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.687e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.167e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.157e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.17e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-202ENST00000382240 1991 ntTSL 221.57■■□□□ 1.047e-7■■□□□ 13.3
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