Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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