Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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