Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B1P20020 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B1P20020 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms