Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms