Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms