Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms