Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms