Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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