Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 SRPK2-210ENST00000477925 1336 ntTSL 57.79□□□□□ -1.165e-30■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 SRPK2-207ENST00000466917 2565 ntTSL 27.14□□□□□ -1.275e-30■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-24■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-24■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 IP6K2-227ENST00000479914 1077 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.352e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 ZC3H15-208ENST00000496289 554 ntTSL 56.43□□□□□ -1.381e-11■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 ZC3H15-207ENST00000481101 558 ntTSL 45.82□□□□□ -1.481e-11■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 ZC3H15-205ENST00000468120 601 ntTSL 45.62□□□□□ -1.511e-11■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-213ENST00000475187 1935 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-201ENST00000358079 2427 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-208ENST00000440771 1006 ntTSL 39.04□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-209ENST00000442555 3012 ntTSL 28.53□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-202ENST00000503078 2375 ntTSL 223.37■■□□□ 1.336e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-201ENST00000330503 2137 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.156e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-205ENST00000505081 2949 ntTSL 215.3■□□□□ 0.046e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-206ENST00000506965 560 ntTSL 514.61□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-210ENST00000509576 819 ntTSL 314.61□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-215ENST00000512431 904 ntTSL 514.31□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.26e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DDX41-203ENST00000504781 618 ntTSL 39.8□□□□□ -0.846e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.528e-12■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.738e-12■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 SUPT5H-207ENST00000594990 558 ntTSL 517.44■□□□□ 0.382e-28■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-28■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-210ENST00000464078 508 ntTSL 519.08■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-207ENST00000436324 1045 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-206ENST00000431390 1552 ntTSL 318.07■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-208ENST00000443046 823 ntTSL 316.17■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-216ENST00000486741 4299 ntTSL 212.37□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-220ENST00000492280 2707 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HMGN1-205ENST00000419378 850 ntTSL 27.07□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 TACC3-208ENST00000484264 551 ntTSL 216.45■□□□□ 0.225e-11■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HNRNPU-225ENST00000640119 461 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-20■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HNRNPU-218ENST00000639064 2625 ntTSL 58.46□□□□□ -1.063e-20■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HNRNPU-208ENST00000475997 5290 ntTSL 55.89□□□□□ -1.473e-20■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 BDP1-203ENST00000508157 3403 ntTSL 54.52□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 LMNA-224ENST00000515711 569 ntTSL 511.58□□□□□ -0.563e-27■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.116e-15■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.156e-15■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-15■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CBX3-205ENST00000462165 949 ntTSL 312.12□□□□□ -0.476e-15■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CBX3-208ENST00000497498 922 ntTSL 25.67□□□□□ -1.56e-15■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CBX3-207ENST00000481300 559 ntTSL 25.18□□□□□ -1.586e-15■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RANBP1-212ENST00000467920 529 ntTSL 25.9□□□□□ -1.466e-10■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 219.3■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.612e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 211.07□□□□□ -0.642e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 26.7□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DNAJC21-204ENST00000509626 779 ntTSL 26.2□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CLNS1A-208ENST00000527265 620 ntTSL 24.92□□□□□ -1.624e-13■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CLNS1A-203ENST00000525359 283 ntTSL 23.87□□□□□ -1.794e-13■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 KLC1-218ENST00000555467 559 ntTSL 225.81■■□□□ 1.725e-14■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.451e-9■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-9■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 BAZ2A-213ENST00000551759 833 ntTSL 511.15□□□□□ -0.626e-27■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 MYO18A-201ENST00000527312 573 ntTSL 210.59□□□□□ -0.711e-9■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 IP6K2-228ENST00000491686 662 ntTSL 25.84□□□□□ -1.471e-9■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 513.99□□□□□ -0.177e-21■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 LSM4-204ENST00000594828 807 ntTSL 224.74■■□□□ 1.558e-8■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.378e-8■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.718e-8■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 LSM4-206ENST00000600289 1113 ntTSL 217.27■□□□□ 0.368e-8■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 LSM4-205ENST00000597776 446 ntTSL 211.37□□□□□ -0.598e-8■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.444e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-210ENST00000561440 1922 ntTSL 215.97■□□□□ 0.154e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-205ENST00000560229 776 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.054e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-204ENST00000559776 760 ntTSL 214.62□□□□□ -0.074e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.164e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-206ENST00000560612 1877 ntTSL 27.55□□□□□ -1.24e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-207ENST00000560639 932 ntTSL 55.65□□□□□ -1.54e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-208ENST00000561068 522 ntTSL 34.9□□□□□ -1.634e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 RPS17-202ENST00000558397 583 ntTSL 34.31□□□□□ -1.724e-16■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.35e-19■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.085e-19■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.15e-19■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.445e-19■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.525e-19■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.685e-19■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-7■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-8■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 27.1□□□□□ -1.272e-53■□□□□ 9.5
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