Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IKZF1Q13422 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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