Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf54Q08AI8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms