Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYL1P12980 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms