Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.9
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PCBP2Q15366 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 43.15□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.089e-8■■■■■ 28.9
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PCBP2Q15366 AC016831.1-203ENST00000418546 578 ntTSL 46.67□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 28.9
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PCBP2Q15366 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-11■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 NUMB-210ENST00000554394 954 ntTSL 38.17□□□□□ -1.16e-9■■■■■ 28.8
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PCBP2Q15366 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.015e-10■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 28.8
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PCBP2Q15366 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 SCRN1-204ENST00000421434 1001 ntTSL 38.56□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 SCRN1-208ENST00000438497 560 ntTSL 48.07□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.224e-12■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 28.8
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PCBP2Q15366 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 28.8
PCBP2Q15366 PKP3-204ENST00000526971 532 ntTSL 218.01■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 28.8
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PCBP2Q15366 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-11■■■■■ 28.8
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PCBP2Q15366 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 28.7
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PCBP2Q15366 USP3-217ENST00000560070 545 ntTSL 48.11□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.257e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 USP3-215ENST00000559771 561 ntTSL 45.28□□□□□ -1.567e-7■■■■■ 28.7
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PCBP2Q15366 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 410.53□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 28.7
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PCBP2Q15366 DNAJC24-211ENST00000532385 369 ntTSL 312.15□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 DNAJC24-205ENST00000526042 2192 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 DNAJC24-209ENST00000529086 2745 ntTSL 25.16□□□□□ -1.589e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 DNAJC24-206ENST00000526529 594 ntTSL 34.88□□□□□ -1.639e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 DNAJC24-204ENST00000525511 417 ntTSL 34.61□□□□□ -1.679e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 DNAJC24-208ENST00000527731 512 ntTSL 33.11□□□□□ -1.919e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 TEAD2-206ENST00000596757 579 ntTSL 514.32□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 217.79■□□□□ 0.445e-10■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-205ENST00000430295 440 ntTSL 220.08■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-206ENST00000438202 652 ntTSL 28.22□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 28.7
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PCBP2Q15366 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 GSTM4-211ENST00000493395 913 ntTSL 39.91□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 28.7
PCBP2Q15366 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 211.8□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 210.87□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.338e-12■■■■■ 28.6
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