Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL4A6Q14031 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL4A6Q14031 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL4A6Q14031 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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COL4A6Q14031 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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