Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms