Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf72Q96LT7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf72Q96LT7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms