Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HRCP23327 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HRCP23327 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HRCP23327 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HRCP23327 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HRCP23327 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HRCP23327 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HRCP23327 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HRCP23327 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HRCP23327 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HRCP23327 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HRCP23327 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms