Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3-202ENST00000394018 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP11B1-201ENST00000292427 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF322-207ENST00000607204 4737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356599.1-205ENST00000606388 3961 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NNT-208ENST00000512996 4288 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF423-202ENST00000535559 4201 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 BARD1-211ENST00000613706 4153 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113189.6-201ENST00000636696 3591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH7-206ENST00000421030 4329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMC2-204ENST00000493293 4313 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTN4P2-201ENST00000473049 1892 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM2-207ENST00000441731 4076 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPS1-211ENST00000520276 4083 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H2BI-201ENST00000377733 381 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA42.2-201ENST00000384771 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139246.1-201ENST00000424657 455 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms