RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.98■□□□□ 0.95
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.55■□□□□ 0.56
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.26■□□□□ 0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ABCC9O60706 1549 aa18.2■□□□□ 0.5
TRPS1-211ENST00000520276 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.43■□□□□ 0.38
TRPS1-211ENST00000520276 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
TRPS1-211ENST00000520276 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-211ENST00000520276 NACADO15069 1562 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.16■□□□□ 0.34
TRPS1-211ENST00000520276 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.1■□□□□ 0.33
TRPS1-211ENST00000520276 SCRIBQ14160 1630 aa17.06■□□□□ 0.32
TRPS1-211ENST00000520276 HRCP23327 699 aa17.05■□□□□ 0.32
TRPS1-211ENST00000520276 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPS1-211ENST00000520276 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TRPS1-211ENST00000520276 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TRPS1-211ENST00000520276 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.6■□□□□ 0.25
TRPS1-211ENST00000520276 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-211ENST00000520276 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-211ENST00000520276 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-211ENST00000520276 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.37■□□□□ 0.21
TRPS1-211ENST00000520276 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.25■□□□□ 0.19
TRPS1-211ENST00000520276 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TRPS1-211ENST00000520276 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TRPS1-211ENST00000520276 MYT1Q01538 1121 aa16.19■□□□□ 0.18
TRPS1-211ENST00000520276 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPS1-211ENST00000520276 SMARCA2P51531 1590 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPS1-211ENST00000520276 SMARCA4P51532 1647 aa16.14■□□□□ 0.17
TRPS1-211ENST00000520276 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.14■□□□□ 0.17
TRPS1-211ENST00000520276 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.12■□□□□ 0.17
TRPS1-211ENST00000520276 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPS1-211ENST00000520276 NCAPD3P42695 1498 aa16.03■□□□□ 0.16
TRPS1-211ENST00000520276 WIZO95785 1651 aa15.96■□□□□ 0.15
TRPS1-211ENST00000520276 ERCC6Q03468 1493 aa15.88■□□□□ 0.13
TRPS1-211ENST00000520276 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TRPS1-211ENST00000520276 HMGXB3Q12766 1538 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TRPS1-211ENST00000520276 NEUROD1Q13562 356 aa15.83■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.81■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.79■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM41Q8WV44 630 aa15.79■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.78■□□□□ 0.12
TRPS1-211ENST00000520276 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.76■□□□□ 0.11
TRPS1-211ENST00000520276 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.75■□□□□ 0.11
TRPS1-211ENST00000520276 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TRPS1-211ENST00000520276 NESP48681 1621 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPS1-211ENST00000520276 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPS1-211ENST00000520276 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.58■□□□□ 0.09
TRPS1-211ENST00000520276 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.58■□□□□ 0.08
TRPS1-211ENST00000520276 CFTRP13569 1480 aa15.55■□□□□ 0.08
TRPS1-211ENST00000520276 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.54■□□□□ 0.08
TRPS1-211ENST00000520276 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.53■□□□□ 0.08
TRPS1-211ENST00000520276 FBLN2P98095 1184 aa15.51■□□□□ 0.07
TRPS1-211ENST00000520276 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
TRPS1-211ENST00000520276 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRPS1-211ENST00000520276 ABCC8Q09428 1581 aa15.41■□□□□ 0.06
TRPS1-211ENST00000520276 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.41■□□□□ 0.06
TRPS1-211ENST00000520276 BCL11AQ9H165 835 aa15.37■□□□□ 0.05
TRPS1-211ENST00000520276 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TRPS1-211ENST00000520276 SOGA1O94964 1423 aa15.35■□□□□ 0.05
TRPS1-211ENST00000520276 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TRPS1-211ENST00000520276 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TRPS1-211ENST00000520276 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TRPS1-211ENST00000520276 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 TOPBP1Q92547 1522 aa15.25■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 CUX2O14529 1486 aa15.23■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.23■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 KIF27Q86VH2 1401 aa15.23■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.22■□□□□ 0.03
TRPS1-211ENST00000520276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 IFT140Q96RY7 1462 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TRPS1-211ENST00000520276 CUX1P39880 1505 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPS1-211ENST00000520276 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TRPS1-211ENST00000520276 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
TRPS1-211ENST00000520276 OSCARQ8IYS5 282 aa15.09■□□□□ 0.01
TRPS1-211ENST00000520276 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.08■□□□□ 0.01
TRPS1-211ENST00000520276 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.08■□□□□ 0.01
TRPS1-211ENST00000520276 WDR62O43379 1518 aa15.08■□□□□ 0
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM2Q13029 1718 aa15.06■□□□□ 0
TRPS1-211ENST00000520276 EEA1Q15075 1411 aa15.06■□□□□ 0
TRPS1-211ENST00000520276 SYNJ1O43426 1573 aa15.06■□□□□ 0
TRPS1-211ENST00000520276 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.05■□□□□ 0
TRPS1-211ENST00000520276 APLP2Q06481 763 aa15.05■□□□□ -0
TRPS1-211ENST00000520276 TOP2BQ02880 1626 aa15.05■□□□□ -0
TRPS1-211ENST00000520276 GRIN2BQ13224 1484 aa15.02■□□□□ -0
TRPS1-211ENST00000520276 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRPS1-211ENST00000520276 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
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