Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms