Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms