Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.767e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-207ENST00000477451 789 ntTSL 525.64■■□□□ 1.77e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-202ENST00000469235 678 ntTSL 324.96■■□□□ 1.597e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 224.42■■□□□ 1.57e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-210ENST00000482962 597 ntTSL 323.26■■□□□ 1.317e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 322.64■■□□□ 1.217e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-205ENST00000473546 291 ntTSL 221.12■□□□□ 0.977e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.267e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.945e-9■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GNB1-206ENST00000471354 1512 ntTSL 523.6■■□□□ 1.372e-8■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-202ENST00000414914 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.88■■□□□ 1.734e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-203ENST00000430798 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.91■■□□□ 1.584e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-212ENST00000496617 538 ntTSL 517.9■□□□□ 0.464e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-209ENST00000489405 1475 ntTSL 512.4□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-204ENST00000438949 873 ntTSL 39.9□□□□□ -0.824e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLCCI1-207ENST00000474269 691 ntTSL 58.44□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.553e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-210ENST00000533742 720 ntTSL 234.1■■■■□ 3.054e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.364e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-207ENST00000531259 572 ntTSL 526.8■■□□□ 1.884e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.994e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.794e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BRF1-218ENST00000550692 600 ntTSL 417.75■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.374e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.294e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 BIRC2-205ENST00000528344 866 ntTSL 511.56□□□□□ -0.564e-10■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.364e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.421e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.271e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-201ENST00000339217 953 ntTSL 341.62■■■■■ 4.251e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.021e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-216ENST00000487164 1060 ntTSL 1 (best)38.81■■■■□ 3.81e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.711e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLS-215ENST00000496170 673 ntTSL 336.81■■■■□ 3.481e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLS-213ENST00000479552 2016 ntTSL 1 (best)36.15■■■■□ 3.381e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.351e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.072e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 31e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.621e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 FAM120C-204ENST00000497680 637 ntTSL 230.47■■■□□ 2.471e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ITGA6-204ENST00000412899 970 ntTSL 1 (best)30.11■■■□□ 2.411e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-207ENST00000520695 658 ntTSL 430.06■■■□□ 2.41e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.321e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-205ENST00000415602 726 ntTSL 328.53■■■□□ 2.161e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.142e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 MOB4-206ENST00000417097 1198 ntTSL 1 (best)27.73■■■□□ 2.031e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ETV6-203ENST00000541426 572 ntTSL 427.64■■■□□ 2.021e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ETV6-204ENST00000544715 733 ntTSL 327.41■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 NELFA-211ENST00000458616 792 ntTSL 327.07■■□□□ 1.925e-9■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.621e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)25.06■■□□□ 1.62e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.552e-7■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-206ENST00000440819 1083 ntTSL 524.62■■□□□ 1.531e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.491e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 MOB4-203ENST00000409355 1130 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 224.07■■□□□ 1.441e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-205ENST00000486418 551 ntTSL 323.92■■□□□ 1.421e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.381e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.181e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-206ENST00000564544 617 ntTSL 322■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-204ENST00000469324 634 ntTSL 321.46■■□□□ 1.031e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-211ENST00000470559 296 ntTSL 521.2■□□□□ 0.981e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.981e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 320.75■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TCEA2-209ENST00000465111 2357 ntTSL 220.56■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-213ENST00000522100 877 ntTSL 320.51■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-201ENST00000264244 1271 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-206ENST00000492164 725 ntTSL 319.89■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 SLC39A11-216ENST00000583715 589 ntTSL 519.52■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-203ENST00000466984 605 ntTSL 518.72■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-204ENST00000562929 452 ntTSL 518.46■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 COX4I1-211ENST00000566405 490 ntTSL 518.02■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 22.9
HNRNPMP52272 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 22.9
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 311.3 ms