RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469324.1

TIMMDC1-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 634 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-204ENST00000469324 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.23■■■□□ 2.91
TIMMDC1-204ENST00000469324 ABCC9O60706 1549 aa29.76■■■□□ 2.35
TIMMDC1-204ENST00000469324 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.67■■■□□ 2.34
TIMMDC1-204ENST00000469324 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMMDC1-204ENST00000469324 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMMDC1-204ENST00000469324 NACADO15069 1562 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMMDC1-204ENST00000469324 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.97■■■□□ 2.07
TIMMDC1-204ENST00000469324 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
TIMMDC1-204ENST00000469324 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.74■■■□□ 2.03
TIMMDC1-204ENST00000469324 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.58■■■□□ 2.01
TIMMDC1-204ENST00000469324 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TIMMDC1-204ENST00000469324 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.49■■□□□ 1.99
TIMMDC1-204ENST00000469324 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.41■■□□□ 1.98
TIMMDC1-204ENST00000469324 SCRIBQ14160 1630 aa27.12■■□□□ 1.93
TIMMDC1-204ENST00000469324 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.05■■□□□ 1.92
TIMMDC1-204ENST00000469324 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.83■■□□□ 1.88
TIMMDC1-204ENST00000469324 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TIMMDC1-204ENST00000469324 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.78■■□□□ 1.88
TIMMDC1-204ENST00000469324 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TIMMDC1-204ENST00000469324 NCAPD3P42695 1498 aa26■■□□□ 1.75
TIMMDC1-204ENST00000469324 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.94■■□□□ 1.74
TIMMDC1-204ENST00000469324 SMARCA4P51532 1647 aa25.86■■□□□ 1.73
TIMMDC1-204ENST00000469324 SMARCA2P51531 1590 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMMDC1-204ENST00000469324 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1-204ENST00000469324 HMGXB3Q12766 1538 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1-204ENST00000469324 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TIMMDC1-204ENST00000469324 ERCC6Q03468 1493 aa25.65■■□□□ 1.7
TIMMDC1-204ENST00000469324 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.63■■□□□ 1.69
TIMMDC1-204ENST00000469324 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.61■■□□□ 1.69
TIMMDC1-204ENST00000469324 NESP48681 1621 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMMDC1-204ENST00000469324 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.58■■□□□ 1.69
TIMMDC1-204ENST00000469324 CUX2O14529 1486 aa25.55■■□□□ 1.68
TIMMDC1-204ENST00000469324 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.49■■□□□ 1.67
TIMMDC1-204ENST00000469324 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMMDC1-204ENST00000469324 WIZO95785 1651 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMMDC1-204ENST00000469324 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1-204ENST00000469324 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1-204ENST00000469324 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TIMMDC1-204ENST00000469324 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.16■■□□□ 1.62
TIMMDC1-204ENST00000469324 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1-204ENST00000469324 MRC2Q9UBG0 1479 aa25■■□□□ 1.59
TIMMDC1-204ENST00000469324 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TIMMDC1-204ENST00000469324 CFTRP13569 1480 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMMDC1-204ENST00000469324 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.92■■□□□ 1.58
TIMMDC1-204ENST00000469324 WDR62O43379 1518 aa24.91■■□□□ 1.58
TIMMDC1-204ENST00000469324 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
TIMMDC1-204ENST00000469324 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1-204ENST00000469324 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TIMMDC1-204ENST00000469324 PRDM2Q13029 1718 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMMDC1-204ENST00000469324 OSCARQ8IYS5 282 aa24.49■■□□□ 1.51
TIMMDC1-204ENST00000469324 TRIM41Q8WV44 630 aa24.48■■□□□ 1.51
TIMMDC1-204ENST00000469324 TOPBP1Q92547 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1-204ENST00000469324 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TIMMDC1-204ENST00000469324 IFT140Q96RY7 1462 aa24.42■■□□□ 1.5
TIMMDC1-204ENST00000469324 ABCC8Q09428 1581 aa24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1-204ENST00000469324 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.33■■□□□ 1.48
TIMMDC1-204ENST00000469324 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1-204ENST00000469324 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1-204ENST00000469324 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1-204ENST00000469324 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1-204ENST00000469324 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMMDC1-204ENST00000469324 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TIMMDC1-204ENST00000469324 SOGA1O94964 1423 aa24.13■■□□□ 1.45
TIMMDC1-204ENST00000469324 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TIMMDC1-204ENST00000469324 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 FBLN2P98095 1184 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 CUX1P39880 1505 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 ARHGEF11O15085 1522 aa24.04■■□□□ 1.44
TIMMDC1-204ENST00000469324 CHD1O14646 1710 aa23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1-204ENST00000469324 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1-204ENST00000469324 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1-204ENST00000469324 WDR97A6NE52 1622 aa23.89■■□□□ 1.42
TIMMDC1-204ENST00000469324 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1-204ENST00000469324 GRIN2BQ13224 1484 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1-204ENST00000469324 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TIMMDC1-204ENST00000469324 ARAP1Q96P48 1450 aa23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1-204ENST00000469324 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1-204ENST00000469324 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1-204ENST00000469324 SYNJ2O15056 1496 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1-204ENST00000469324 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMMDC1-204ENST00000469324 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
TIMMDC1-204ENST00000469324 SYNJ1O43426 1573 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMMDC1-204ENST00000469324 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.7■■□□□ 1.39
TIMMDC1-204ENST00000469324 PBRM1Q86U86 1689 aa23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1-204ENST00000469324 TOP2BQ02880 1626 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1-204ENST00000469324 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1-204ENST00000469324 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1-204ENST00000469324 GRIN2AQ12879 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMMDC1-204ENST00000469324 ADAMTS12P58397 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1-204ENST00000469324 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMMDC1-204ENST00000469324 NUP160Q12769 1436 aa23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1-204ENST00000469324 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1-204ENST00000469324 CEP170Q5SW79 1584 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1-204ENST00000469324 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1-204ENST00000469324 JPH4Q96JJ6 628 aa23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1-204ENST00000469324 SHROOM2Q13796 1616 aa23.33■■□□□ 1.32
TIMMDC1-204ENST00000469324 IGF1RP08069 1367 aa23.29■■□□□ 1.32
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