RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496170.1

GLS-215, Transcript of glutaminase, human

TSL 3

Gene GLS, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLS-215	ENST00000496170	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57	■■■■■ 6.72
GLS-215	ENST00000496170	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.51	■■■■■ 5.68
GLS-215	ENST00000496170	ABCC9	O60706	1549 aa		49.39	■■■■■ 5.5
GLS-215	ENST00000496170	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.65	■■■■■ 5.22
GLS-215	ENST00000496170	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.51	■■■■■ 5.2
GLS-215	ENST00000496170	NACAD	O15069	1562 aa		47.5	■■■■■ 5.19
GLS-215	ENST00000496170	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.5	■■■■■ 5.19
GLS-215	ENST00000496170	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.28	■■■■■ 5.16
GLS-215	ENST00000496170	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.14	■■■■■ 5.14
GLS-215	ENST00000496170	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.38	■■■■■ 5.02
GLS-215	ENST00000496170	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.24	■■■■■ 4.99
GLS-215	ENST00000496170	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.16	■■■■■ 4.98
GLS-215	ENST00000496170	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.1	■■■■■ 4.97
GLS-215	ENST00000496170	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.58	■■■■■ 4.89
GLS-215	ENST00000496170	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.28	■■■■■ 4.84
GLS-215	ENST00000496170	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.86	■■■■■ 4.77
GLS-215	ENST00000496170	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.64	■■■■■ 4.74
GLS-215	ENST00000496170	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.44	■■■■■ 4.7
GLS-215	ENST00000496170	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.16	■■■■■ 4.66
GLS-215	ENST00000496170	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.14	■■■■■ 4.66
GLS-215	ENST00000496170	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.95	■■■■■ 4.63
GLS-215	ENST00000496170	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.94	■■■■■ 4.62
GLS-215	ENST00000496170	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.89	■■■■■ 4.62
GLS-215	ENST00000496170	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.84	■■■■■ 4.61
GLS-215	ENST00000496170	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.72	■■■■■ 4.59
GLS-215	ENST00000496170	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.63	■■■■■ 4.57
GLS-215	ENST00000496170	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
GLS-215	ENST00000496170	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.53	■■■■■ 4.56
GLS-215	ENST00000496170	WIZ	O95785	1651 aa		43.45	■■■■■ 4.55
GLS-215	ENST00000496170	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
GLS-215	ENST00000496170	NES	P48681	1621 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GLS-215	ENST00000496170	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GLS-215	ENST00000496170	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.64	■■■■■ 4.42
GLS-215	ENST00000496170	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
GLS-215	ENST00000496170	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GLS-215	ENST00000496170	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.52	■■■■■ 4.4
GLS-215	ENST00000496170	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.39	■■■■■ 4.38
GLS-215	ENST00000496170	CFTR	P13569	1480 aa		42.39	■■■■■ 4.38
GLS-215	ENST00000496170	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.2	■■■■■ 4.35
GLS-215	ENST00000496170	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.11	■■■■■ 4.33
GLS-215	ENST00000496170	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.06	■■■■■ 4.32
GLS-215	ENST00000496170	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
GLS-215	ENST00000496170	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GLS-215	ENST00000496170	CUX2	O14529	1486 aa		42.01	■■■■■ 4.32
GLS-215	ENST00000496170	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.94	■■■■■ 4.3
GLS-215	ENST00000496170	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.93	■■■■■ 4.3
GLS-215	ENST00000496170	WDR62	O43379	1518 aa		41.78	■■■■■ 4.28
GLS-215	ENST00000496170	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.69	■■■■■ 4.27
GLS-215	ENST00000496170	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.45	■■■■■ 4.23
GLS-215	ENST00000496170	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.44	■■■■■ 4.22
GLS-215	ENST00000496170	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.39	■■■■■ 4.22
GLS-215	ENST00000496170	CUX1	P39880	1505 aa		41.21	■■■■■ 4.19
GLS-215	ENST00000496170	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.15	■■■■■ 4.18
GLS-215	ENST00000496170	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.12	■■■■■ 4.17
GLS-215	ENST00000496170	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.04	■■■■■ 4.16
GLS-215	ENST00000496170	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.01	■■■■■ 4.16
GLS-215	ENST00000496170	SOGA1	O94964	1423 aa		40.99	■■■■■ 4.15
GLS-215	ENST00000496170	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
GLS-215	ENST00000496170	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.97	■■■■■ 4.15
GLS-215	ENST00000496170	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.96	■■■■■ 4.15
GLS-215	ENST00000496170	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GLS-215	ENST00000496170	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GLS-215	ENST00000496170	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GLS-215	ENST00000496170	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.79	■■■■■ 4.12
GLS-215	ENST00000496170	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
GLS-215	ENST00000496170	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
GLS-215	ENST00000496170	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.65	■■■■■ 4.1
GLS-215	ENST00000496170	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GLS-215	ENST00000496170	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.49	■■■■■ 4.07
GLS-215	ENST00000496170	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GLS-215	ENST00000496170	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GLS-215	ENST00000496170	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.38	■■■■■ 4.05
GLS-215	ENST00000496170	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GLS-215	ENST00000496170	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04
GLS-215	ENST00000496170	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GLS-215	ENST00000496170	FBLN2	P98095	1184 aa		40.28	■■■■■ 4.04
GLS-215	ENST00000496170	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.2	■■■■■ 4.03
GLS-215	ENST00000496170	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
GLS-215	ENST00000496170	CHD1	O14646	1710 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GLS-215	ENST00000496170	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GLS-215	ENST00000496170	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.15	■■■■■ 4.02
GLS-215	ENST00000496170	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.14	■■■■■ 4.02
GLS-215	ENST00000496170	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.04	■■■■■ 4
GLS-215	ENST00000496170	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.03	■■■■■ 4
GLS-215	ENST00000496170	IGF1R	P08069	1367 aa		40.01	■■■■■ 4
GLS-215	ENST00000496170	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GLS-215	ENST00000496170	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.87	■■■■□ 3.97
GLS-215	ENST00000496170	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		39.85	■■■■□ 3.97
GLS-215	ENST00000496170	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.81	■■■■□ 3.96
GLS-215	ENST00000496170	CUL7	Q14999	1698 aa		39.76	■■■■□ 3.96
GLS-215	ENST00000496170	NUP160	Q12769	1436 aa		39.76	■■■■□ 3.96
GLS-215	ENST00000496170	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.76	■■■■□ 3.96
GLS-215	ENST00000496170	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.72	■■■■□ 3.95
GLS-215	ENST00000496170	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.65	■■■■□ 3.94
GLS-215	ENST00000496170	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.62	■■■■□ 3.93
GLS-215	ENST00000496170	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.62	■■■■□ 3.93
GLS-215	ENST00000496170	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.62	■■■■□ 3.93
GLS-215	ENST00000496170	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		39.51	■■■■□ 3.92
GLS-215	ENST00000496170	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		39.47	■■■■□ 3.91
GLS-215	ENST00000496170	EEA1	Q15075	1411 aa		39.46	■■■■□ 3.91

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