Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT4P35916 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT4P35916 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT4P35916 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms