Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 RBBP4-217ENST00000526193 568 ntTSL 46.44□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-211ENST00000477563 544 ntTSL 55.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-207ENST00000430992 496 ntTSL 34.51□□□□□ -1.694e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-205ENST00000415049 456 ntTSL 43.71□□□□□ -1.824e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.914e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBMS1-211ENST00000477486 562 ntTSL 416.56■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ORC4-213ENST00000496670 645 ntTSL 52.3□□□□□ -2.047e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AL645568.1-201ENST00000367716 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 219.69■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 215.87■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-213ENST00000475890 2080 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GSTCD-204ENST00000484843 2228 ntTSL 214.42□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 DLG4-210ENST00000493294 573 ntTSL 313.94□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GALNT12-203ENST00000610463 550 ntTSL 413.86□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-218ENST00000491654 578 ntTSL 513.57□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AP2A1-204ENST00000594838 611 ntTSL 313.41□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-216ENST00000564136 3071 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CHEK2-210ENST00000416671 2560 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GTF2E2-205ENST00000523499 768 ntTSL 412.98□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-204ENST00000379850 2379 ntTSL 512.61□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PPME1-208ENST00000543525 1928 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 312.56□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SNRNP200-202ENST00000429650 2637 ntTSL 212.4□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-205ENST00000424845 558 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-13■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-220ENST00000548698 455 ntTSL 512.08□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SH3BGR-206ENST00000440288 585 ntTSL 511.38□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COX11-204ENST00000572558 1054 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-218ENST00000575207 575 ntTSL 411.25□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ARHGAP11B-209ENST00000602616 5637 ntTSL 311.25□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GSTCD-210ENST00000515255 1373 ntTSL 211.18□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-206ENST00000424990 565 ntTSL 411.16□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 LINC00355-201ENST00000456627 1878 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-219ENST00000498635 585 ntTSL 410.73□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-220ENST00000565351 297 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-207ENST00000437073 581 ntTSL 410.42□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-233ENST00000569222 443 ntTSL 310.42□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COX11-209ENST00000576370 2663 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-13■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIAS3-208ENST00000484423 1042 ntTSL 29.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GALK2-220ENST00000560654 784 ntTSL 59.8□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GSTCD-203ENST00000394730 4043 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CSAD-214ENST00000483632 558 ntTSL 49.43□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KIFC3-234ENST00000569619 698 ntTSL 39.39□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ACSM3-202ENST00000440284 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 59.37□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-220ENST00000576149 2444 ntTSL 59.29□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIAS3-209ENST00000498436 1142 ntTSL 59.21□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SNRNP200-206ENST00000484372 581 ntTSL 29.2□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CHEK2-209ENST00000405598 1959 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 KLHL22-210ENST00000487090 596 ntTSL 39.15□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 202.5 ms