RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475890.5

CSAD-213, Transcript of cysteine sulfinic acid decarboxylase, humanhuman

TSL 5

Gene CSAD, Length 2,080 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAD-213ENST00000475890 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.03■■■□□ 2.88
CSAD-213ENST00000475890 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.58■■■□□ 2.17
CSAD-213ENST00000475890 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CSAD-213ENST00000475890 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.34■■□□□ 1.97
CSAD-213ENST00000475890 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
CSAD-213ENST00000475890 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.2■■□□□ 1.94
CSAD-213ENST00000475890 ABCC9O60706 1549 aa27.01■■□□□ 1.91
CSAD-213ENST00000475890 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.79■■□□□ 1.88
CSAD-213ENST00000475890 NACADO15069 1562 aa26.57■■□□□ 1.84
CSAD-213ENST00000475890 SCRIBQ14160 1630 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAD-213ENST00000475890 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CSAD-213ENST00000475890 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.31■■□□□ 1.8
CSAD-213ENST00000475890 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CSAD-213ENST00000475890 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.92■■□□□ 1.74
CSAD-213ENST00000475890 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CSAD-213ENST00000475890 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.75■■□□□ 1.71
CSAD-213ENST00000475890 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.62■■□□□ 1.69
CSAD-213ENST00000475890 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.6■■□□□ 1.69
CSAD-213ENST00000475890 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CSAD-213ENST00000475890 HRCP23327 699 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAD-213ENST00000475890 MYT1Q01538 1121 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAD-213ENST00000475890 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CSAD-213ENST00000475890 WIZO95785 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
CSAD-213ENST00000475890 SMARCA4P51532 1647 aa25.34■■□□□ 1.65
CSAD-213ENST00000475890 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.3■■□□□ 1.64
CSAD-213ENST00000475890 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CSAD-213ENST00000475890 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.97■■□□□ 1.59
CSAD-213ENST00000475890 SMARCA2P51531 1590 aa24.89■■□□□ 1.57
CSAD-213ENST00000475890 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.87■■□□□ 1.57
CSAD-213ENST00000475890 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.87■■□□□ 1.57
CSAD-213ENST00000475890 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSAD-213ENST00000475890 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CSAD-213ENST00000475890 TRIM41Q8WV44 630 aa24.67■■□□□ 1.54
CSAD-213ENST00000475890 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CSAD-213ENST00000475890 NCAPD3P42695 1498 aa24.56■■□□□ 1.52
CSAD-213ENST00000475890 HMGXB3Q12766 1538 aa24.53■■□□□ 1.52
CSAD-213ENST00000475890 ABCC8Q09428 1581 aa24.51■■□□□ 1.51
CSAD-213ENST00000475890 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CSAD-213ENST00000475890 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAD-213ENST00000475890 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.39■■□□□ 1.5
CSAD-213ENST00000475890 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAD-213ENST00000475890 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CSAD-213ENST00000475890 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CSAD-213ENST00000475890 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
CSAD-213ENST00000475890 SYNJ1O43426 1573 aa24.16■■□□□ 1.46
CSAD-213ENST00000475890 CFTRP13569 1480 aa24.11■■□□□ 1.45
CSAD-213ENST00000475890 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.11■■□□□ 1.45
CSAD-213ENST00000475890 SOGA1O94964 1423 aa24.08■■□□□ 1.45
CSAD-213ENST00000475890 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAD-213ENST00000475890 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 PRDM2Q13029 1718 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 TOP2BQ02880 1626 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAD-213ENST00000475890 CUX1P39880 1505 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAD-213ENST00000475890 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAD-213ENST00000475890 EEA1Q15075 1411 aa23.88■■□□□ 1.41
CSAD-213ENST00000475890 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.84■■□□□ 1.41
CSAD-213ENST00000475890 NESP48681 1621 aa23.82■■□□□ 1.4
CSAD-213ENST00000475890 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CSAD-213ENST00000475890 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAD-213ENST00000475890 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CSAD-213ENST00000475890 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAD-213ENST00000475890 GOLGA3Q08378 1498 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAD-213ENST00000475890 KIF21BO75037 1637 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.62■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.61■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.59■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 CEP162Q5TB80 1403 aa23.57■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.54■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 KIF27Q86VH2 1401 aa23.54■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 TOPBP1Q92547 1522 aa23.52■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 NEUROD1Q13562 356 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 CUX2O14529 1486 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 PRXQ9BXM0 1461 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.45■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.42■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.41■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 IGF1RP08069 1367 aa23.36■■□□□ 1.33
CSAD-213ENST00000475890 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.33■■□□□ 1.33
CSAD-213ENST00000475890 CLIP1P30622 1438 aa23.31■■□□□ 1.32
CSAD-213ENST00000475890 BCL11AQ9H165 835 aa23.29■■□□□ 1.32
CSAD-213ENST00000475890 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CSAD-213ENST00000475890 WDR97A6NE52 1622 aa23.26■■□□□ 1.31
CSAD-213ENST00000475890 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.23■■□□□ 1.31
CSAD-213ENST00000475890 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.2■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAD-213ENST00000475890 ARAP1Q96P48 1450 aa23.09■■□□□ 1.29
CSAD-213ENST00000475890 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.08■■□□□ 1.29
CSAD-213ENST00000475890 WDR62O43379 1518 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.3 ms