Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms